GMP實驗室屬於潔淨實驗室，一個完整的gmp實驗室，大致分為以下幾個功能區。
（一）準備室
準備室用於配製培養基和樣品處理等。室內設有試劑櫃、存放器具或材料的專櫃、實驗台、電爐、冰箱和上下水道、電源等。
GMP實驗室
（二）洗滌室
洗滌室用於洗刷器皿等。由於使用過的器皿已被微生物汙染，有時還會存在病原微生物。因此，在條件允許的情況下，最好設置洗滌室。室內應備有加熱器、蒸鍋，洗刷器皿用的盆、桶等，還應有各種瓶刷、去汙粉、肥皂、洗衣粉等。
（三）滅菌室
滅菌室主要用於培養基的滅菌和各種器具的滅菌，室內應備有高壓蒸汽滅菌器、烘箱等滅菌設備及設施。
（四）無菌室
無菌室也稱接種室，是係統接種、純化菌種等無菌操作的專用實驗室。在微生物工作中，菌種的接種移植是一項主要操作，這項操作的特點就是要保證菌種純種，防止雜菌的汙染。在一般環境的空氣中，由於存在許多塵埃和雜菌，很易造成汙染，對接種工作幹擾很大。
gmp實驗室應配置儀器設備：
包括：流式細胞儀、PCR儀、超速/高速/低速離心機、液氮裝置、血細胞自動分離機、生物安全櫃、CO2培養箱等。
